Hubert sa narodil 20. februára v Mníchove, kde jeho otec Sebastia, bol bankový úradník. Od 1947 do 1956 navštevoval gymnázium Humanistische Karls a potom študoval na Technickej vysokej škole, kde v roku 1960 získal aj diplom. Na univerzite zostal a venoval sa štúdiu kryštálografie aby objasnil štruktúru organických zlúčenín. V súčasnosti je ženatý a má štyri deti.
V roku 1971 sa stal riaditeľom Biochemického inštitútu Maxa Plancka, kde jeho tím pracoval na metóde kryštálografie proteínov.
